Ökoloogia Instituut on Tallinna Ülikooli teadus- ja arendusasutus
Instituudi põhitegevuseks on loodusteaduslikud alusuuringud järgmistel põhisuundadel:
Erimastaapsete looduslike ja antropogeensete protsesside ajalis-ruumilise mõju hindamine ökosüsteemide seisundile, paleoökoloogiliste uurimismeetodite arendamine, ökosüsteeemide arengustsenaariumite koostamine.
Kliimatingimuste muutuse ja rannikumere hüdrodünaamika mõju uurimine eritüüpi randade arengule. Randade arengu mudelite ja rannikuvööndis asetleidvate muutuste kohta prognooside koostamine.
Märgalaökosüsteemide seisundi ja arengu ning seda mõjutavate tegurite, eeskätt häiringute mõju uurimine märgalade struktuurile, talitlusele ja aineringele; uurimismeetodite arendamine ning märgalade ökoloogilise taastamise teaduslike printsiipide väljatöötamine.
Samuti osaletakse rakenduslike uuringutega järgmistes suundades:
Maavarade kaevandamisega seotud probleemide ja välisõhu saastatuse uuringud (Kirde-Eestis), samuti keskkonnaseisundit ja looduskaitset hõlmavad uuringud ning ekspertiisid.